实验中心的专兼职实验教师和技术人员每年都接受了安全培训，参加了消防演习，使实验人员能够明确并有效采用应急措施保护学生安全，同时备有消防器材，定期维护保养，及时更换。在主要门廊设置了监控摄像头，由专门的物业管理人员及安全保卫部门 24 小时监控，且对部分实验室安装了防盗门、防盗网。中心领导对安全工作高度重视，在做到日常的安全检查基础上，在每年的节假日、寒暑假期间均组织人员认真进行防火、防盗安全大检查。实验室各种安全标识清晰、完善，安全责任明确并有相关记录。

实验中心大部分教学均通过联网计算机完成，因此实验教师和技术人员均严格按照相关规定，落实对计算机病毒、网络入侵和攻击破坏等行为的防范措施如安装保护卡和防火墙，交换机上进行了网段的划分，可以有效防止来自于网络内部的攻击，加强网络内部用户的管理和控制，保证了实验中心的安全。对反动、淫秽色情、暴力等有害信息进行过滤和封堵，对重要数据库实行定期备份，建立系统操作人员和上网人员身份认证机制，加强对学生上网的宣传与管理，切实保障网络的运行安全、信息安全以及计算机机房、网络设备的实体安全。实验教学中心五年内无任何安全事故发生。

中心严格执行《重庆大学实验室安全卫生制度》、《重庆大学仪器设备借出、丢失、损坏赔偿处理办法》、《重庆大学机构人员异动资产交接管理（试行）办法》、《实验教学中心防火防盗防事故规定》等制度。中心有防火、防爆、防盗、防破坏安全措施，中心所在大楼安装了实时监控器，每个实验室都装备有火灾报警器与灭火器；每个实验室都指定了安全及设备仪器管理责任人，节假日轮流值班，并按照相应制度进行管理和检查。除每年学校、学院组织的对实验室的防火防盗检查外，中心还经常对师生开展安全教育，八年来无安全事故和偷盗事故的发生。